Quatre ans après l’apparition des Neighbors à Mikado, la vie a presque repris son cours normal grâce à l’action du Border. C'est dans ce contexte que Yûma arrive dans la ville et vit sa première expérience au Japon.

Osamu et Yûma ne s’attardent pas dans le périmètre de sécurité, là où ce dernier a terrassé le soldat-trion. Le Border retrouve sa carcasse, sans comprendre comment cette menace a pu être écartée sans l’intervention d’un de ses agents…

Deux Neighbors ont outrepassé le système de guidage du Border et fait irruption hors du périmètre de sécurité. Osamu ne peut se résoudre à voir ses camarades se faire massacrer en attendant les agents titulaires, et va les défendre malgré les mises en garde de Yûma.

Si la décision d’Osamu d’activer son Trigger a permis de sauver les élèves du collège, ce choix à l’encontre des règles du Border est aussi critiqué par certains. Ai Kitora, une des stars de l’unité Arashiyama, estime qu’il mérite une sanction sévère et le suit jusqu’au QG.

L’apparition anormale de l’Ilgar dans la zone urbaine est maîtrisée par les efforts de Kitora et Yûma, tandis qu’Osamu se rend utile en venant au secours des habitants coincés sous les décombres. Ceci pourrait jouer en sa faveur lors de la réunion du Border qui doit décider de son sort.

Le Border se reconcentre sur le fléau qui s’abat sur Mikado : les portails anormaux qui apparaissent dans la zone urbaine et entraînent de lourds dégâts. C’est la combinaison inattendue du Side Effect de Jin et des connaissances de Replica qui va permettre de tirer cette affaire au clair.