L'ospedale precipita nella spirale della rovina finanziaria e Owen deve prendere decisioni difficili. Intanto Alex e Jo lavorano insieme per salvare un neonato e April chiede consigli amorosi a Jackson.
Si diffonde la voce dei guai finanziari del Seattle Grace e Catherine sollecita Jackson a trasferirsi a Boston.Gli specializzandi sono preoccupati. Intanto i dottori si incontrano con un potenziale investitore per salvare l'ospedale.
Il team insegue un serial killer che sembra seguire le date del tour di una rockstar del movimento dark e sospetta che l'artista abbia confuso se stesso con l'alter-ego che impersona sul palco.
Una madre prende una decisione relativa allo stato vegetativo in cui versa il figlio, e questo innesca un conflitto tra il dottor Halstead e la dottoressa Manning.
Il ferimento via proiettile del dottor Charles arriva in tribunale, e le cose si complicano per medici e infermieri del Chicago Med in questa apertura di terza stagione.