Si diffonde la voce dei guai finanziari del Seattle Grace e Catherine sollecita Jackson a trasferirsi a Boston.Gli specializzandi sono preoccupati. Intanto i dottori si incontrano con un potenziale investitore per salvare l'ospedale.
L'ospedale precipita nella spirale della rovina finanziaria e Owen deve prendere decisioni difficili. Intanto Alex e Jo lavorano insieme per salvare un neonato e April chiede consigli amorosi a Jackson.
Robin è alle prese con delle complicazioni, mentre un nuovo personaggio si affaccia in ospedale in questo finale di stagione.
Il team insegue un serial killer che sembra seguire le date del tour di una rockstar del movimento dark e sospetta che l'artista abbia confuso se stesso con l'alter-ego che impersona sul palco.
Il ferimento via proiettile del dottor Charles arriva in tribunale, e le cose si complicano per medici e infermieri del Chicago Med in questa apertura di terza stagione.