Tales of the Teenage Mutant Ninja Turtles

Bishop ricompare con un unico scopo: trovare i mutanti e distruggerli. Leonardo si trova da solo ad affrontare i robot e ne esce indenne anche grazie all'aiuto di April. È la prima volta che si trova a combattere un nemico senza i suoi fratelli.

Miki vuole salvare i suoi fratelli dalla furia di Bishop e Rod vuole diventare un mutante. Per questo decidono di aiutarsi a vicenda stringendo un patto: Miki gli darà il suo sangue e Rod chiamerà il padre, che finanzia Bishop, per fermarla.

Raffaello si ritrova rinchiuso in una fabbrica abbandonata. Quando arriva il Mechazoid di Bishop, Raff deve liberarsi e seguendo il suggerimento di Michelangelo, comincia a raccontare barzellette. Una volta libero, sconfigge il robot.

I robot di Bishop continuano a dare la caccia alle Tartarughe. Ora è Donatello che deve affrontarne uno particolarmente tenace. Per sfuggirgli, entra nella metropolitana e si rende conto che Bishop ha preso il controllo del sistema informatico.

Bishop per continuare il suo lavoro ha bisogno di denaro e lo ottiene da Rod Senior, ma in cambio deve dare un lavoro al figlio, Rod Junior. Il progetto di Bishop è di costruire dei robot in grado di dare la caccia ed eliminare i mutanti.

Bishop ha creato i Mechazoid per distruggere ogni mutante presente sulla Terra, ma non poteva prevedere che si sarebbero scagliati anche contro gli umani. Per combatterli, Bishop è obbligata ad allearsi con le Tartarughe.