高校の課題をしている3人。息抜きをしようとする彼らだったが、事故を起こしてしまう、そして彼らは、驚くべき力を手に入れる。

身につけた新しい力に慣れてきたフレックス・ファイターズは、ルックとチャーター・シティーの両方をつぶそうとする謎の「ニンジャ」に出会う。

ハッカーのサーキット・ストリームが、物質を通り抜ける力を手に入れる。街を襲う敵を止めるべく、フレックス・ファイターズが活躍する。

問題を解決しようと頑張るストレッチとフレックス・ファイターズ。その間、謎の悪者がルックの発明である「助っ人」を操ろうと企む。

ストレッチ・モンスターの助けを借り、過去に街を牛耳っていたボスが悪の世界を乗っ取る。そして、フレックス・ファイターズとケインが力を合わせ悪党に挑む。