外来種のビルマニシキヘビに食い荒らされるフロリダ州エバーグレーズ。その侵略を食い止めるため、ルイジアナ州から沼地のハンターが招集される。ハンターたちは慣れないヘビ狩りに苦戦しながらも地元のスネーク･ハンターのビルと、順調に捕獲を続けていく。そんな中、夜の狩りに出かけたところで、予想外の事態が発生する。

事故が多発することで知られる地、エバーグレーズ･トライアングルを訪れたハンターたちは、二手に分かれてニシキヘビの駆除に挑む。ビル、ブルース、ザックの3人はロケット格納庫の不気味な廃墟でビルマニシキヘビを捕獲し、トロイと息子のチェイスは牧場で極めて危険な種であるアフリカニシキヘビを追う。

ヘビ狩りは3週目に入ったが、その生息域は予想以上に広く、駆除は簡単には進まない。そこでビルたちは追跡装置を使ったり、サーマルカメラを搭載したドローンを利用したりしてヘビを追う。一方、世界最大のヘビ、オオアナコンダの捕獲に向かったブルースとザックは湿地のど真ん中で予期せぬトラブルに見舞われる。

エバーグレーズでの最終週を迎えたハンターたち。トロイとチェイスは、地域の人々を悩ませている恐ろしいワニの捕獲に向かう。一方、ビル、ブルース、ザックは、新たに誕生した交配種の巨大ヘビを探す。トロイたちも合流して捜索へ向かう5人だが、果たして危険な巨大ヘビの増殖を止めることはできるだろうか?

ワニ猟シーズンが終わり、沼地の熟練ハンターたちがエバーグレーズに再集結。今もこの地で猛繁殖を続けているビルマニシキヘビとの闘いが再び始まる。今回は2チームに分かれてヘビの駆除に挑む。ブルースとザックは他のハンターが寄り付かない謎の獣人スカンクエイプが目撃されたエリアに向かい、背筋が凍る体験をする。

トロイとチェイスはビルに連れられ、水深の深いポイントへ。しかし泳ぎが得意なビルマニシキヘビに苦戦を強いられる。一方、ブルースとザックは猛毒のガラガラヘビやヌママムシがひしめき合う森での狩りを試みる。森の奥深くで毒ヘビに噛まれたら一巻の終わり。果たして無事に収穫を得て森を抜けられるのか?