ロックマンエグゼ

200X年。インターネット等の発達により、人類はネットワークの時代を迎えていた。誰もが、ネットナビという擬似人格プログラムが組み込まれた“PET”と呼ばれる携帯情報端末を持っている。小学五年生の光熱斗と彼のオリジナルネットナビ・ロックマンエグゼは、謎の組織・WWW(ワールドスリー)の凶悪犯罪に巻きこまれてしまう。

ネコ型ロボに噛みつかれケガで入院したデカオを見舞いにデンサンタウンへ出かけた熱斗とメイル。町では人々が暴走した電化製品に襲われ、混乱に陥っていた。WWW(ワールドスリー)のエレキ伯爵&エレキマンの仕業だ。エレキ伯爵の策略により暴走する地下鉄に乗ってしまった熱斗たち。はたして暴走列車を止められるのか!?

熱斗のクラスに、飛び級で進級した女の子、綾小路やいとが転校してきた。大金持ちのやいとに振りまわされる熱斗とデカオ。その翌日、WWW(ワールドスリー)の色綾まどい&カラードマンは、秋原町の信号機にウイルスを送り街中を渋滞させていた。信号機にプラグインした熱斗は、交通管制センターがウイルスに支配されていることを知る。

熱斗の通う学校に特別講師としてやってきた日暮闇太郎。ところが、レアチップマニアの日暮は、やいとの持つレアチップを目当てに、やいとたちを教室に閉じ込めて自分のナビ、ナンバーマンとバトルさせ、チップを奪おうとする。教室外にいる熱斗は、教室にかけられたロックを解き、無事やいとたちを助け出せるのか…？

WWW(ワールドスリー)のボス・ワイリーの指揮のもと、エレキ伯爵たちが計画したのはロボット水族館のウイルスによる乗っ取り。結果、町は暴走する魚ロボがあふれ大混乱。電脳世界にプラグインしたロックマンは、巨大な津波に飲みこまれそうになるが、突如謎のナビが出現する…。