ミラーワールドからなんとか脱出した真司だが、その日から龍の影につけ狙われていた。神崎優衣は真司に「封印」のカードを渡し、これで龍型のモンスターを封印すれば、訳の分からないことに巻き込まれずに、これまで通りの暮らしを続けられると教える。

仮面ライダー龍騎となった真司。彼の許に現われたのは、行方不明になった優衣の兄･神崎士郎だった。カードデッキと仮面ライダーをつくり出した男。士郎は「ライダーを倒すんだ」と、謎めいた言葉を真司に残す。そんな兄の真意を疑う優衣に、真司は…。

少女を襲うダークウイング。蓮はモンスターを強化しようとするあまり、ダークウイングに人間を襲わせているのか? 真司の疑念をよそに、蓮の不審な行動は止まらない。だが優衣は真司の言葉に耳を貸そうとしなかった。そして、真司は蓮との対決に臨む。