帰ってきたウルトラマン

世界的な異常気象の中、しばらく出現していなかった怪獣たちが一斉に目を覚ました。東京湾を蹂躙するタッコングとザザーンを迎え撃つのは、怪獣攻撃隊MAT（マット）である。街の人々が逃げ惑う中、レーサー志望の青年、郷秀樹は逃げ遅れた少年と子犬を救出するが、彼自身が命を落としてしまい…。

怪獣タッコングが再び出現した。ウルトラマンと一体化した郷秀樹は自分の力を過信したことから隊長の命令に背き、結果的にタッコングを取り逃がしてしまう。MATを除隊され坂田自動車工場へと戻る郷に、坂田は敢えて冷たく接する。その態度に、郷は自分の思い上がりに気づく。

郷は霧吹山上空のパトロール中に怪獣の咆哮を耳にするが、それは郷の超感覚によって聴こえた音であったため、MATアローに同乗していた上野隊員には聴こえていなかった。郷と上野の意見の対立を見かねた加藤隊長は真偽を確かめるため単身で霧吹山へと向かったが、そこに怪獣サドラが出現しピンチに陥ってしまう。

第一原子力発電所付近に、怪獣キングザウルス三世が出現した。郷はウルトラマンに変身するが、キングザウルス三世にはウルトラマンの必殺技が通じなかった。怪獣が発生させるバリヤーを飛び越えるキック技を会得するしか、倒す術はない。郷は坂田の協力を経て、過酷な特訓を始める。

工事現場で岩石状の物体が発見された。処理をめぐって郷と岸田の意見が対立するなか、砕石場に地底怪獣グドンが出現する。一方、岩石状の物体からは古代怪獣ツインテールが現れ、新宿副都心はパニックとなった。郷はウルトラマンに変身してツインテールと戦うが、そこにグドンも現れる。

二大怪獣の猛攻に、さしものウルトラマンも敗れた。MATのMN爆弾も効果がない二大怪獣に対して岸田長官はスパイナーの使用を決断するが、加藤隊長は激しく異議をとなえた。小型水爆級の威力があるスパイナーを使用したら、東京は壊滅してしまう。隊員達はMATの解散を賭け、スパイナーを使用しない作戦に挑戦する。