クリストファー･メローニが再びエリオット･ステイブラー役として登場。大切な人を失ったステイブラーはNY市警に戻り、組織犯罪と闘う。だが、彼が去ってから街も警察内部も様変わりし、彼は刑事司法制度に順応しなければいけない。そして司法制度自体も審判を下されようとしている。ステイブラーは精鋭部隊である新たな特捜班を率いて街の強大な犯罪組織を1つずつ解体していく一方、赦しを求め、人生を立て直そうとする。