あきる野警察署で誤認逮捕が明るみとなり、若き女性署長･新海晶 (観月ありさ) の謝罪会見が行われた。型通りの原稿を読む晶だったが、突然晶は「個人的な見解を」と口火を切り、強引な自白誘導があったことを暴露してしまう。女性署長の“内部告発”に世間は賛否両論。捜査一課長･武邑 (田山涼成) と首席管理官･有富 (風見しんご) は晶を署長に抜てきした警察庁長官官房教養担当主任･東出 (遠藤憲一) の前で怒りを露に。「警視庁管内で仕事はさせられない」と人事権のある東出に詰め寄るが、東出にはある目論見があり…。

ホストの北野 (本宮泰風) が、ゴミの出し方を注意した自治会長の日出子 (梅沢昌代) を刺殺した。送致書には「北野と被害者の姿を向かいの家に住む受験生が目撃」とあるが、夜の8時過ぎに被害者宅のリビングはレースのカーテンだけだったとか。不審に感じた晶 (観月ありさ) は検証を開始する。

若い女性を次々にナイフで殺害。殺した順に腹に数字を書き込む猟奇殺人事件が発生した。3人目の里桜 (広瀬アリス) 殺害後、現場近くを歩いていた高校生の寺本 (石黑英雄) が逮捕されたが、寺本は完全黙秘を続けていた。しかし、被害者･里桜の血痕が検出されたナイフや里桜のピンクの傘を持っていたことなどから犯行は寺本によるものと断定され、送致書が検証捜査係に送られてきた。容疑者が未成年であるため、警察･検察共に急ぎ送検を目指すが、そんな時にこそ捜査に誤りが起きやすいと感じた晶は早速、検証を開始する。

強行犯係から届いた送致書を訂正しながら一瞬首をかしげる小暮 (片岡鶴太郎)。小暮が何かにひっかかっている事に気づいた晶 (観月ありさ) は、送致書を取り上げ長谷部 (五十嵐隼士) に読ませる。被害者は家具店勤務の田口 (乃木涼介)。首吊り自殺のように見えたが、検視官が首を絞められ抵抗した際に残る吉川線を発見。他殺の可能性も含めて捜査をした所、最近になってもめていたという交際相手の美波 (堀内敬子) の指紋が、現場のゴミ箱に捨てられていた睡眠薬のシートから検出された。事情を聞いたところ田口とは婚活サイトで知りあったが、自分が結婚詐欺師であることがバレたため、田口を睡眠薬で眠らせ絞殺したと犯行を自供。

元警視庁捜査一課の刑事で、永友 (田辺誠一) のライバルと言われていた須賀谷 (神尾佑) の転落遺体が発見された。須賀谷は7年前に警視庁を退職していたが、元警察官の死に、マスコミ対策を考える警察上層部は自殺で処理をしようとするが、思わぬ元同僚の死に動揺する永友は他殺の可能性も捨てきれず、晶ら検証捜査係に「7年前の事件」を検証して欲しいと依頼するのだった。

捜査一課の唐沢 (橘慶太) が大手総合商社の爆弾テロ事件の送致書を「最優先で」と検証捜査係へやってきた。さっそく晶 (観月ありさ) は送致書を長谷部 (五十嵐隼士) に読ませると、大手商社の本社ビルで何者かが仕掛けた爆弾が爆発、社長は難を逃れたが、来客として同社を訪れていた治子 (泉晶子) が重傷を負ったという。爆弾のタイマーとして使用された市販のデジタル時計の購入者から、土井 (忍成修吾) という自然保護活動に参加するカメラマンが浮上。