메이지 64년 도쿄시. 고서점을 운영하는 유키무라는 정부에 반기를 드는 자들을 비밀리에 말살하는 '누에'의 처형인 중 하나였다. 유키무라는 누에의 동료인 츠키시로, 하나카제와 함께 도쿄성 완공 기념 피로연에서 요시노부의 암살을 꾀하는 반체제파 조직의 수장 쟈노메 제거를 명령받았다. 이에 츠키시로와 하나카제는 피로연에 잠입해 정보를 모으고, 유키무라는 지하도에서 무언가를 기다리며 대기했다. 그녀의 앞에 나타난 것은 쟈노메가 만들어 낸 이형 짐승. 푸른 피의 힘으로 변신한 유키무라는 그 짐승과 맞서 싸우는데...

확보해놓았던 명부에 적혀 있는 도쿠가와 정부의 요인들이 살해당하고 있었다. 누에 안에 배신자가 있다고 판단한 진은 츠키시로에게 배신자 조사를, 유키무라와 하나카제에겐 금고지기 쿄코의 호위를 명령했다. 금고지기를 호위해 도망치던 중, 유키무라는 자신의 고향인 카라스모리 집성촌에서 일어난 일족 몰살 사건의 진실이 쿄코의 머릿속에 있다는 걸 알게 된다. 그러는 와중에 유키무라가 자리를 비운 고서점에 모습을 드러낸 츠키시로는 아사히에게 어떤 약을 건네주는데...

금고지기의 살해를 명령한 건 진이었으며 이것은 곧 요시노부의 바람대로였다. 마음을 가라앉힐 길이 없는 유키무라를 츠키시로는 면밀히 지켜보면서, 복수를 하는 과정에서 아사히에게 위험한 일이 생길 수 있다는 걸 시사하고 떨어져 지낼 것을 조언했다. 이에 마음이 흔들렸던 유키무라는 어떤 결정을 내렸다. 한편 츠키시로의 조사를 통해 배신자가 청소부였다는 것이 밝혀지자 유키무라, 츠키시로, 하나카제는 청소부를 불러냈는데.

아사히를 데리고 간 사람은 바로 원수인 쟈노메였다. 유키무라는 아사히를 구출하기 위해 나섰지만 진에 의해 저지당하고 말았다. 진은 유키무라를 데리고 가려 했지만, 배신자인 츠키시로에게 유키무라를 빼앗기고 만다. 쟈노메의 본거지까지 끌려오게 된 유키무라는 그렇게 쟈노메와의 해후를 이루었다. 이에 유키무라는 격분하며 칼을 겨눴는데.

오빠인 타케루와 함께 죽기로 결심한 유키무라. 하지만 타케루는 아사히의 존재를 상기시키고는 유키무라를 감싸고 사망했다. 유키무라는 아사히를 데리고 적의 본거지에서 탈출했지만, 복수를 끝내고 오라버니를 잃은 유키무라는 상실감에 젖어있었다. 그 무렵, 하나카제는 자신이 임신했음을 깨닫고 조직으로부터 빠져나오기로 결심했다. 유키무라는 미래를 향해 발을 내딛는 그녀의 모습에 감명받았지만, 다음 날 아침 누군가의 시체를 발견하게 되는데...

유키무라가 먹은 약은 가사 상태에 빠지게 만드는 약이었다. 아사히는 츠키시로에게서 전해 들은 말을 떠올리면서, 주변을 속여가며 유키무라와 도망치기 위해 분투했다. 한편 요시노부에게 부름을 받은 진은, 츠키시로가 가지고 있는 쟈노메의 신약을 뺏어오고 신약의 재료가 되는 푸른 피를 가진 유키무라 또한 헌상할 것을 명령받았는데.