아시나카 학원 고등학교는, 하나의 섬으로 이루어진 특이한 학교이다. 학교 옥상에서, ‘시로’라고 불리는 ‘이사나 야시로’는, 어린 고양이 한 마리와 점심을 먹고 있었다. 점심 식사 후, 같은 반 친구인 구쿠리에게 학예회 준비 심부름을 부탁 받은 시로는, 다리를 건너 거리로 향한다. 하지만 그곳에서 왠지 무서운 표정의 남자들로부터 쫓기게 되는데...

시로의 앞에 나타난 야토가미 쿠로라는 소년은 불가사의한 권술을 사용해 시로를 궁지에서 구해 준 것처럼 보였다. 하지만 그 소년도, 기억도 하지 못하는 시로를 죽이려 한다. 시로는 순간의 재치로 그에게서 도망쳐 나오지만, 야토가미 쿠로는 학교섬의 기숙사까지 뒤쫓아 온다. 한편 시로와 함께 있던 어린 고양이가 갑자기 미소녀로 변하는데...

시로를 일곱 명의 왕 중의 하나인 ‘무색계의 왕’이라 부르는 쿠로. 쿠로에게 처단되지 않기 위해, 시로는 도츠카 타타라의 살해의 누명을 벗어야만 한다. 학교 안을 돌아다니며 자신의 알리바이를 증명하려는 시로와 그 옆을 꼭 붙어 다니는 네코. 한편, 청국의 크란과 적국의 크란은 시로에 대한 단서를 얻게 되는데…