Scooby-Doo, Sammy, Fred, Véra et Daphné ont gagné des places à la loterie pour profiter d'un voyage dans l'espace à bord du vaisseau spatial d'un Baron milliardaire. Alors que tous les amis s'amusent dans cet environnement sans pesanteur, un étrange extraterrestre vient saboter la navette. Bientôt, l'équipage est contraint d'atterrir sur la base du Baron située sur le côté obscur de la lune.