À bord de l'avion présidentiel, le commandant de Marine Ray Trapp décède sous les yeux de Kate Todd, un agent des services secrets. Il a été pris de convulsions après avoir dîné avec George W. Bush.

En pleine nuit, lors d'un exercice de saut, un Marine ne parvient pas à ouvrir la toile de son parachute. En chute libre, il s'écrase sur une voiture. L'équipe de la N.C.I.S. se rend sur les lieux pour déterminer l'origine du drame : accident ou sabotage criminel ?

Un groupe de jeunes gens sont dérangés par des coups de feu. Alertés, ils assistent au naufrage d'un bateau sur la plage. Pendant ce temps, l'équipe d'Enquêtes Spéciales est prévenue que le corps d'un capitaine vient d'être retrouvé au large des côtes. L'équipe ne tarde pas à faire le lien entre ce meurtre et celui de deux hommes mêlés à un trafic de drogue. Gibbs reste cependant sceptique quant à l'implication d'un capitaine dans une affaire aussi douteuse.

En plongeant dans la mer, un jeune homme découvre le corps d'un marine habillé en tenue de cérémonie et arborant une étrange épée. L'enquête menée par l'équipe du N.C.I.S. ne tarde pas à découvrir que le jeune marine, Russell MacDonald, faisait partie d'un cercle d'adeptes de jeux de rôle.

L'agent Gibbs et son équipe sont à nouveau sur la brèche. Dans une forêt du Maryland, un chasseur a découvert le réservoir d'un avion militaire contenant un cadavre momifié. Après enquête, tout porte à croire qu'il s'agit du lieutenant Marc Gils, officier payeur sur le porte-avions Eisenhower. Dix ans plus tôt, celui-ci a été disparu en mer le jour-même où une forte somme d'argent a été dérobée dans le coffre-fort du navire. Le rapport de l'époque laisse supposer que Gils est coupable du vol.

Confronté à une affaire de drogue, Stan, un ancien équipier de Gibbs, l'appelle en renfort. Lors d'une escale, Wilkes est retrouvé dans un état second dû à une prise régulière de métamphétamines. Interrogé par Gibbs, il jure ne s'être jamais drogué et paraît sincèrement dépassé par ce qui lui arrive. Un autre cas semblable au sien survient au cours d'un exercice d'appontage. Dans le même temps, Wilkes décède à priori d'une crise cardiaque. L'autopsie de Ducky démontre qu'il s'agit d'un meurtre.