Merlí, un prof de philo divorcé, âgé de 50 ans, est affecté au lycée Àngel Guimerà. Son arrivée n'est pas du goût de tout le monde. Il met rapidement les élèves dans sa poche par son approche accessible de la philosophie, mais les autres les enseignants n'apprécient pas sa façon d'agir. Chez lui, Merlí tente de recoller les morceaux avec Bruno, son fils, qui est aussi l'un de ses élèves.

Toni, le directeur, avertit Merlí qu'il doit respecter les règles du lycée, mais le prof de philo n'en a cure et demande à ses élèves d'écrire des poèmes. Avec Eugeni, le professeur de catalan, Merlí s'efforcent de soutenir Ivan, un garçon qui souffre d'agoraphobie. Bruno confie un secret à Tania, sa meilleure amie.

Gina, la mère de Gérard, l'un des lycéens, félicite Merlí pour la façon dont il s'occupe de ses élèves. De son côté, Bruno, le fils de Merlí, estime que la suspension des examens qui étaient prévus est due à son père. Comme il risque d'aller vivre avec sa mère, Merlí met tout en oeuvre pour conserver sa garde. La fin justifie-t-elle toujours les moyens ?

Bruno et Pol, un autre élève, décident d'étudier ensemble, mais leur rendez-vous se termine mal. Eugeni, le professeur de catalan peu apprécié des élèves, se demande si les deux garçons n'essayent pas de tricher. Merlí lui essaye de régler les problèmes de tout le monde et de maintenir une bonne entente au sein de la classe.

Le père de Joan, le meilleur élève de la classe, pense que Merli a endoctriné son fils. Tania a des problèmes avec Berta, une lycéenne dissipée, ce qui affecte sa relation avec Bruno. Quant à Gina, elle s'en prend à Merlí parce qu'il a exclu Gérard. De son côté, le prof de philo s'efforce de faire sortir Ivan de chez lui.

Berta ne supporte plus Merlí et s'oppose à lui devant toute la classe. Gerard a hâte d'effectuer un travail de classe avec Monica, la nouvelle venue. De son côté, Merlí incite ses élèves à ne pas croire naïvement tout ce qu'on leur apprend à l'école.