コードネーム：ウイスキー・キャバリエ ふたりは最強スパイ

FBI捜査官・ウィルは、婚約者だったジジのことが忘れられず悲しみに浸っていた。そんななか、機密情報を盗んだNSA職員・エドガーの身柄を引き取るためモスクワへ飛んだウィルは、レストランである女性と出会う。

今回の任務は、ギリシャの海運王・スタヴロスの裏帳簿を入手すること。帳簿が保管されている金庫を開けるには網膜スキャンが必要なため、スタヴロスを捕らえようとするが、突然現れた女がスタヴロスを射殺し...。

大富豪・クルデーレ率いるネオファシスト・グループが技術者・アンドリューズに爆弾を作らせようとしているのを阻止するため、ウィルたちはローマへ飛ぶ。チームはパーティに潜入し、アンドリューズを連れ出すが...。

大手製薬会社が闇市場で催眠剤を販売している証拠を掴むため、ウィルたちはブルガリアへ。奪った密輸トラックから赤ん坊が見つかり、人身売買組織の存在を知ったチームは、命令がないまま組織の壊滅を決意する。