Asano, un investigador para la policía de Japón, visita a Logan en Nueva York. Le explica que el padre de su exnovia Mariko Yashida está arreglando un matrimonio para ella. Su padre, Shingen Yashida, es el líder de la organización criminal Kuzuryu.

Habiendo caído en la trampa de Shingen, Logan termina en apuros, pero lo rescata una misteriosa mujer llamada Yukio. Más tarde, Logan visita el refugio de Asano y lo encuentra muerto. Logan es considerado sospechoso de la muerte de su amigo.

Kikyo Mikage, un asesino mutante de Shingen que tiene armas de adamantio, ataca a Logan, quien está huyendo de la policía. En el escape, él y Yukio descubren la operación secreta de contrabando de Kurohagi.

Logan y Omega Rojo tienen una pelea feroz. La pelea trae a colación su historia en común y cómo Wolverine conoció a Omega Rojo. ¿Podrá Logan vencer al behemot ruso?

La pelea entre Omega Rojo y Logan continúa mientras el equipo de Asano descubre que Logan no es responsable de su muerte. Con una victoria por poco, Logan se dirige a buscar a Shingen, donde encuentra a Kikyo esperándolo.

Logan finalmente logra vencer a Omega Rojo, y él y Yukio vuelan a Madripoor, la ciudad atormentada por el crimen, donde se casará Mariko. Las cosas empiezan mal con los locales, y Yukio y Logan son separados.