Steve McGarrett kallas hem till Honolulu för att begrava sin far efter att han mördats av en galning. Guvernör Jameson vill att Steve leder en ny elitinsatsstyrka, och hon vill ge honom full auktoritet för att slutföra jobbet. Han säger först nej, men när han möter mannen som leder utredningen av hans fars mördare ändrar han sig så att han kan hitta sin fars mördare själv.
Teamet måste utreda döden av en professor från Oahu Universitet. Hans chef, hans assistent och en elev som fuskade är alla misstänkta.
När Chin kidnappas och dumpats i Halawa-fängelset klädd som en fånge, måste han desperat slåss för att rymma innan de andra fångarna fattar att han är från Five-0.
Teamet möter inrikesdepartementet, korrupta snutar och en mäktig kokain-kartell när de utreder mordet på Dannys f.d. partner, som hittats död på en hawaiisk luau med sin bricka i munnen.
När McGarrett kidnappas av Wo Fat ser han vad som kunde hänt om teamet tagit en annan väg, i den hundrade avsnittet.
