Art Jeffries (Bruce Willis), ancien agent du FBI, doit protéger Simon, un enfant autiste de 9 ans qui a piraté le nouveau coe du gouvernement fédéral réputé inviolable. Il est capable de déchiffrer Mercury, le code crypté le plus évolué du moment développé pour plus d'1 milliard de Dollar, aussi facilement qu'un enfant peut lire. L'aptitude exceptionnelle de Simon rend ce nouveau code secret beaucoup trop vulnérable, surtout si cette information parvenait aux oreilles d'ennemis de L'Etat qui pourraient alors capturer Simon et utiliser son savoir. Le responsable du projet Nick Kudrow (Alec Baldwin) ordonne alors l'élimination immédiate de l'enfant sous couvert de "menace pour la sécurité de l'Etat". C'est sans compter sur Jeffries. Pourchassés par des tueurs à gages, Jeffries réalise rapidement qu'il ne peut faire confiance à personne et que leur seule chance de survie repose sur les connaissances de Simon pour déjouer le complot et révéler la vérité au grand jour.