Cliff « Method Man » Smith

Ziggy perd sa chère Camaro auprès de trafiquants de drogues, insensibles aux prétextes avancés pour ne pas payer. Incapable de refiler l'enquête pour homicide à d'autres brigades, le colonel Rawls menace Bunk d'un blâme si l'affaire n'est pas résolue. À cause d'un produit de mauvaise qualité, toxicos et autres dealers mettent la pression sur Bodie. Les détectives d'homicides citent à comparaître devant un grand jury les dockers impliqués dans l'affaire d'homicide et l'agent de la police portuaire Beadie Russell essaie de ranimer la flamme avec un ancien petit ami, également docker, pour essayer de savoir comment la cargaison a disparu des docks. Au sein de l'équipe, chacun réclame que l'enquête pour homicide soit intégrée à celle sur Frank Sobotka et sa bande du syndicat.

Dans le premier épisode de la saison 3, une vague de réformes urbaines entraîne la démolition des fameuses tours Franklin Terrace, obligeant les dealers de Barksdale à élire domicile ailleurs. Stringer Bell met au point une nouvelle stratégie de vente en attendant le retour d'Avon. McNulty, Greggs et l'équipe essaient de réunir des preuves contre Stringer en mettant sur écoute un cartel de la drogue, dirigé par son allié Proposition Joe. Affectés à la brigade des stups du district ouest, Carver et Herc mettent la pression sur les dealers. Burrell se fait prendre dans une attaque en force du conseiller Tommy Carcetti. Le maire Clarence Royce, qui se représente aux élections l'année prochaine, prévient Burrell que les statistiques concernant le crime doivent baisser. Des ordres émanant des instances supérieures ont mis les chefs de la police sur le grill pendant les réunions de la commission. Daniels se retrouve également dans le collimateur de l'hôtel de ville et sa promotion semble remise en question. Une vague de meurtres met fin à la journée de Bunk sur le terrain de baseball. À la veille de sa libération conditionnelle, Cutty Wise se voit proposer par Avon un nouveau départ à l'extérieur.

Omar poursuit ses frappes audacieuses sur les planques de Barksdale, désormais bien gardées. Sous les ordres de Stringer Bell, Bodie doit subir un test critique face à Marlo. Tandis que les écoutes de Proposition Joe ne donnent pas grand-chose, McNulty décide de mener sa propre enquête concernant le suicide de D'Angelo Barksdale l'année dernière en prison. Dans la rue, les cadavres s'accumulent, poussant Burrell et Rawls à faire pression auprès de leurs chefs de district. La violence dans la rue impose également à Daniels la difficile décision de mettre fin ou non à la guerre des narcotiques dans les quartiers est. Cheese perd plus que son pari dans un combat de chiens sanglant et est ensuite arrêté par Bunk et McNulty pour être interrogé au sujet d'un meurtre. Débordé, Cutty essaie de se remettre en piste et cherche un emploi en dehors du milieu de la drogue. Carver, Herc et la brigade des stups du quartier ouest décident d'infiltrer des agents dans la rue, mais une transaction tourne mal, ce qui pousse le major commandant 'Bunny' Colvin à remettre en question ses 30 années de carrière.

Alicia et Louis Canning rivalisent pour rallier le maximum de clients dans une affaire de santé publique de grande envergure. Le cabinet détecte alors l'existence d'une taupe, qui semble travailler pour Canning.

Deux femmes sont retrouvées mortes dans des appartements situés l'un au-dessus de l'autre. Les enquêteurs découvrent rapidement un lien : Drops, directeur artistique de boîtes de nuit et vieille connaissance de l'équipe de Grissom, est le propriétaire des deux logements. Drops est alors libéré provisoirement pour aider la police à retrouver le coupable.