Une expédition de chasse au dragon amène Ant à trouver un ancien parchemin contenant des indices sur un mystère étonnant. Cependant, sa famille est piégée par le dragon et seuls Ant et Jeffrey peuvent les sauver.

Les pirates du Dark Orca attaquent parce qu'ils croient que les Nekton ont un trésor rare à bord de leur sous-marin. Pour s'échapper, Kaiko va devoir guider l'Aronnax à travers un volcan sous-marin en éruption.

Une nouvelle intelligence artificielle dirigeant le sous-marin empêche les Nekton de sauver un kayakiste parce que c'est trop dangereux. Lorsque les Nekton tentent de l'arrêter, elle prend complètement le relais.

L'objet que Will et Ant récupèrent du plus profond de l'océan n'est pas ce à quoi ils s'attendaient. Ils ont été dupés et voila qu'il y a désormais un passager clandestin sur l'Aronnax qui essaie d'en prendre le contrôle.

Ant pense qu'il est parfaitement raisonnable que des extraterrestres volent des objets sur une île et les ramènent sous l'eau. Les nektoniens enquêtent mais trouvent quelque chose de bien plus dangereux.

Quelqu'un vient de voler la tortue la plus rare au monde. Les Néktoniens partent à sa recherche. Cependant, ils ne savent pas que l'homme qui l'a volée veut secrètement les capturer eux aussi, et ils tombent dans un piège.