Le Dr Scully est chargée de surveiller les activités d'un certain agent Mulder pour définir si son travail est digne d'intérêt pour le FBI. Il l'emmène en Oregon enquêter sur le meurtre de plusieurs lycéens qu'il pense être les victimes d'expériences pratiquées par des extra-terrestres...

Contre la volonté de leur hiérarchie, Mulder et Scully enquêtent sur la disparition d'un pilote d'essai dans une base aérienne de l'US Air Force en Idaho. Mulder soupçonne des expériences sur des appareils utilisant une technologie extra-terrestre...

Un meurtre atroce commis dans un lieu sans aucune voie d'accès ressemble à des affaires non-classées datant de 1933 et 1963. Mulder et Scully tentent de traquer et d'arrêter ce tueur en série centenaire...

Une femme qui prétend avoir vu un ovni dans son enfance voit sa fille disparaître au cours d'une excursion en camping. Tout semble indiquer l'implication d'extraterrestres…

Dans le New Jersey en 1947, un homme est attaqué alors qu'il réparait un pneu sur la route près des bois. Son cadavre est retrouvé plus tard avec sa jambe blessée, un humanoïde velu est tué à proximité.

Quand deux cadavres sont découverts en Philadelphie, Mulder et Scully sont chargés de l'enquête. La piste les mène vers une secrétaire en deuil de son employeur qui vient de se suicider, apparemment protégée par une mystérieuse force surnaturelle…