Primo episodio. Quando uno degli ufficiali di Pike scompare durante una missione segreta per la Flotta, Pike deve interrompere il suo esilio.

Durante una missione esplorativa, la U.S.S. Enterprise scopre che una cometa sta per colpire un pianeta disabitato. L'equipaggio cerca di dirottarla, ma un'antica reliquia aliena sepolta sotto la superficie ghiacciata della cometa blocca i suoi tentativi.

La U.S.S. Enterprise è colpita da un'epidemia che devasta la nave. L'intero equipaggio viene contagiato a parte Numero Uno, Una Chin-Riley, che ora dovrà confrontarsi con il segreto che nascondeva mentre cerca di trovare una cura.

Durante una missione di routine su una colonia, la U.S.S. Enterprise viene attaccata da una sconosciuta forza ostile.

Mentre sta conducendo insieme al capitano Pike dei negoziati cruciali con un'insolita specie aliena, Spock riceve una visita personale e la situazione si trasforma in una commedia.

Una minaccia a un pianeta idilliaco riunisce il capitano Pike con l'amore della sua vita. Per proteggere lei e un bambino sacro da un complotto, Pike offre il suo aiuto ed è costretto ad affrontare sentimenti irrisolti.