송연우는 여자인 것을 숨긴 채 남학교인 통천서원에 입학한다. 그리고 입학과 동시에 경성 사공자와 얽히게 되는데...

송연우는 통천서원에서 뛰어난 학우들과 함께 수업을 듣기 시작한다. 하지만 통천서원에서 쫓겨날 궁리만 하는 최초혁과 사사건건 부딪히는데...

최초혁과 갈등이 깊어지는 가운데 공자 윤은 송연우가 여자인 것을 눈치채고 보호해 준다. 그러던 어느 날, 공자 윤은 갑자기 병으로 쓰러지는데...

통천서원의 불량배인 풍단청이 식당에서 극독에 중독되고, 범소여가 음식에 독을 넣은 범인으로 지목돼 서원에서 쫓겨난다. 송연우는 진실을 밝히기 위해 범소여의 집으로 향하고 뜻밖에 그곳에서 최초혁을 만나는데...

송연우는 친구인 방일청과 란자가 통천서원 옆 혜심학당에 다니게 되자 몹시 기뻐한다. 송연우는 몰래 혜심학당 안을 엿보다가 따라온 최초혁과 함께 손 상궁에게 붙잡혀 갇히고 마는데...

손 상궁은 송연우와 최초혁을 억류하고 통천서원 공 사부의 사과를 요구한다. 공 사부가 손 상궁을 회피하자 학생들은 손 상궁과 공 사부가 만나도록 몰래 자리를 마련하는데...