En serie som kretsar kring Lincoln Burrows som dömts till döden för ett mord han inte har begått. Hans bror Michael Scofield planerar i detalj hur han ska rädda sin bror och rånar en bank i avsikt att hamna i samma fängelse som honom. Räddningen visar sig dock, när han tvingas beblandas med några av fängelsets farligaste män, bli svårare och mer komplicerad än han tidigare trott.