En 1995, Jim Fitzgerald, nouveau profiler au FBI, rejoint l'équipe chargée d'identifier et d'arrêter un terroriste plus connu sous le nom d'Unabomber. Il recommande de nouvelles méthodes de profilage mais personne ne le prend au sérieux.

Lorsque l'insaisissable Unabomber menace de faire exploser un avion de ligne, Fitz doit déterminer si la menace est réelle. En 1997, Fitz va devoir affronter Ted Kaczynski pour la première fois.

La linguiste Natalie Rogers aide Fitz à trouver des indices sur l'identité de l'Unabomber dans le Manifeste, mais leurs découvertes se heurtent au scepticisme de l'UTF. En 1997, Ted affirme qu'il peut invalider toutes les preuves contre lui.

Unabomber assure qu'il mettra fin aux explosions si son manifeste est publié. Fitz fait pression en faveur de la publication avec S.A.C. Ackerman, qui présente l'argument de Fitz au procureur général Janet Reno.

Dans une lettre destinée à son frère, Ted évoque un personnage important de son enfance ainsi qu'une incapacité à nouer des relations qui le hante encore aujourd'hui. Ces éléments ont mené à son engagement dans des activités terroristes.