아인이라 불리는 존재가 자기 자신임을 깨달은 나가이 케이는 사람들의 눈에 띄지 않는 곳으로 도망친다. 도움을 청할 사람을 찾던 케이는 고민 끝에 전화번호를 지웠던 예전 친구에게 통화를 건다.

카이토와 함께 경찰을 따돌리고 도망치는 케이는 하나뿐인 친구의 도움에 그나마 위안받는다. 하지만 포상금을 노린 추적자들이 차례차례 나타나면서 둘은 위기에 처하는데… 절체절명의 순간, 카이의 절규가 마치 마취약처럼 주변 사람들을 굳어버리게 만든다.

불량배들의 추적을 따돌린 케이와 카이토지만 머지않아 추격자가 또 따라붙고 둘은 낭떠러지 밑으로 떨어지고 만다. 케이는 카이토의 상태를 걱정하지만 오히려 그의 도움으로 위기를 벗어 난다. 이즈미는 케이에 대한 조사를 위해 그의 여동생을 방문한다.

혼자 행동하기로 결심하고 카이토의 휴대폰을 훔쳐 아지트를 떠나는 케이. 그런데 그때 카이의 휴대폰이 울린다. 발신자는 에리코. 하지만 전화 저편에서 들려오는 목소리는 에리코가 아닌 어떤 장년 남성이었다.

아인 연구소로 끌려온 케이는 끔찍한 인체실험을 당하게 된다. 그런데 극심한 고통 속에서 흐느끼고 이를 악무는 카이에게 누군가가 말을 걸어온다. 죽이라고, 인간들을 증오하라고…

케이는 결국 사토가 원하는 복수의 화신으로는 완성되지 못했다. 이에 낙담한 사토는 머리를 잘라 케이의 자아를 죽이고 새로운 케이로 만드려 한다. 케이는 사토로부터, 그리고 연구시설에서 도망치기 위하여 필사적으로 작전을 짜는데…