Le Dr John Watson reprend sa carrière médicale en tant que directeur d'une clinique spécialisée dans le traitement des maladies rares, six mois après la mort de son ami et partenaire, Sherlock Holmes, aux mains de Moriarty.

Watson et ses collègues enquêtent sur le cas perplexe d'un père de famille avec une balle logée dans la tête qui insiste qu'il est un soldat écossais et semble cacher quelque chose de néfaste.