La vie devient une course contre la montre pour Hank Galliston lorsque sa femme, Laila, est enlevée par le terroriste international White Vincent. En tant qu'éditeur d'un magazine spécialisé dans les phénomènes paranormaux, le Modern Skeptic, Hank a passé sa carrière à détruire les mythes et à mener des enquêtes sur les complots. Désormais, il se trouve impliqué dans un des plus grands complots de l'histoire de l'humanité, complot déclenché lorsque sa femme découvre une vieille horloge dans un marché aux puces de Brooklyn. Cet horloge possède biens plus que le pouvoir de donner l'heure. Avec l'aide de l'agent du F.B.I. Rebecca Riley et de ses deux jeunes employés, Rachel et Arron, il se lance dans l'aventure pour retrouver Laila, mais ne tardent pas à découvrir que leur mission est bien plus importante que sauver une femme.

Démarrage sur les chapeaux de roue pour Hank qui cherche sa femme, Laïla. Avec Rebecca, il va frôler la mort dans une confrontation avec Vincent qui s'enfuit dans le grand nord canadien. Confronté à plus de questions que de réponses, non seulement concernant sa femme mais aussi sa propre existence, Hank part à la recherche de l'horloge suivante. Déterminé à découvrir un indice dans l'espoir de comprendre son passé, et la femme qu'il aime, il part avec Rebecca en Inde où il fait une découverte qui va bouleverser sa vie. Pendant ce temps, Rachel et Arron suivent une autre piste qui les mène au dernier voyage du mystérieux commandant Rose.

Plus que jamais déterminé à retrouver sa femme, Hank revient d'Inde à la recherche de nouveaux indices pendant que Laila, retenue prisonnière par White Vincent, doit réparer la prochaine horloge pour lui. Elle sème des indices derrière elle pour aider Hank à la retrouver. Après une nouvelle confrontation avec White Vincent, Hank commence à prendre conscience que la situation est bien plus complexe qu'il n'y parait. De leur côté, les parents de Hank semblent dissimuler un lourd secret depuis longtemps. Avec l'aide du F.B.I., Hank, Arron et Rachel découvrent qu'un personnage historique de premier plan détient la clé qui permettra d'ouvrir la prochaine horloge.

Vincent, grièvement blessé, retient Laïla captive dans un repaire. Devant la gravité de ses blessures et le sentant vulnérable, Laïla lui propose de le soigner, tout en cherchant un moyen de s'enfuir. Comprenant qu'il n'est pas en état de le faire lui-même, Vincent oblige Hank à lui apporter la prochaine horloge en le menaçant de tuer Laïla s'il refuse. Hank va risquer sa vie, tout en négligeant les sombres avertissements des Bergers. Il va se rendre compte, après le choc provoqué par les informations sur sa femme et sur la disparition de Théo, le mari de Rebecca, que les gens ne sont pas toujours ce qu'ils laissent paraître.

Hank se sent frustré et perdu par rapport à Laila. Peu à peu, il se demande qui elle est réellement et quel rôle elle a joué avec lui. Un nouvel indice envoit Hank et Rebecca à Asuncion au Paraguay. Ils ne se doutent pas qu'ils suivent de près White Vincent. Celui-ci détient des informations stupéfiantes sur le passé de Hank et sur les liens qu'ils ont pu avoir à une époque. Pendant ce temps, Arron et Rachel rencontrent Mélanie Lynch, directrice du Trust 41, également connue sous le nom de "Mère" pour l'interviewer. Cette dernière semble être particulièrement intéressée par la Sainte Croix, mais reste évasive dans ses réponses.

Toujours en quête de réponses concernant son passé, Hank va voir ses parents pour les interroger sur sa naissance et son enfance. Conscients qu'ils ne peuvent pas se taire plus longtemps, mais effrayés de l'effet que pourrait avoir la vérité sur Hank, ceux-ci passent aux aveux. Toutefois, Hank a immédiatement l'impression que ses parents ne lui racontent pas tout. Vincent se remémore son enfance et réfléchit aux destinées parallèles que Hank et lui-même ont vécues. Pendant ce temps, la piste des horloges conduit Rebecca, Arron et Rachel à Istanbul en Turquie. En cherchant à en savoir plus sur son "double", le commandant Korbin Sturm, Hank va rencontrer un homme qui détient plus de clés qu'il n'aurait pu l'imaginer.