La reine Aeleonore raconte l'histoire de la transformation de la paisible Mobotropolis en Robotropolis, lorsque l'horrible Robotnik et son armée de soldats s'en sont pris aux créatures vivant dans ce monde pour les robotiser et les réduire en esclavage. À la suite de cette tragédie, la reine fut contrainte d'abandonner ses trois petits, Sonia, Manic et Sonic, qui furent élevés loin les uns des autres.

Louvois et Dur-Dur sont à la poursuite d'Argus, le capitaine de la garde royale, qui est le seul qui sait où se trouve la Reine. À force de ruses, les deux sbires de Robotnik finissent par le capturer.

À l'occasion de leur anniversaire, nos vaillants amis décident de visiter leur ville natale, la légendaire Mobourg-Latour, qui n'apparaît que le deuxième jour pair du troisième mois, espérant y retrouver leur mère.

Sonia rend visite à son amie Betty à Super Mobius en compagnie de ses deux frères. Alors qu'elles font les boutiques, Sonia remarque la belle montre que son amis porte au poignet.

Sonic, Sonia et Manic sont de passage dans la ville du duc de Velchronia qui organise un grand bal. Max, un jeune pickpocket, dérobe l'ornement qui se trouvait sur la voiture de Louvois et Dur-Dur, qui le prennent aussitôt en chasse.

Alors que les hérissons ont prévu une intervention dans l'usine de robots de Robotnik, Sonic rencontre Cyrus, un ancien membre de la résistance, qui lui demande de l'aide. Il lui explique que Lionel, son père, a été fait prisonnier par Robotnik.