FBI 특수 요원인 멀더와 그의 파트너 스컬리는 불가사의한 사건들을 담당하는 부서에 배정받는다. 두 사람은 내막이 감추어진 사건들의 실마리를 쫓아 파헤치며, 그 진실을 밝혀내기 위해 고군분투한다.
에피소드 1
파일럿
과거의 사례를 연상시키는 여자의 죽음을 수사하게 된 FBI는 멀더에게 사건을 배정하고, 스컬리에게 감시역을 맡긴다.
에피소드 2
내부 고발자
멀더는 조종사의 실종에 관심을 가지지만, 정체불명의 남자가 그에게 군 당국이 연루된 사건에서 손을 뗄 것을 권유한다.
에피소드 3
불사
현재 조사 중인 사건이 1903년에 발생했던 미해결 사건과 유사하다는 걸 알게 된 스컬리와 멀더는 정체를 알 수 없었던 연쇄 살인범을 찾아낸다.
에피소드 4
귀향
스컬리는 멀더가 관심을 보이며 수사를 자처한 사건이 어린 시절 실종된 그의 여동생 사만다와 관계가 있음을 알게 된다.
에피소드 5
식인 원시인
멀더와 스컬리는 식인 행위로 추측되는 살인 사건을 수사하기 위해 1947년의 유사한 사례가 존재하는 뉴저지주로 향한다.
에피소드 6
그림자
멀더와 스컬리는 블레빈스 국장의 소개를 받은 기관의 의뢰로 기이한 사후 경직이 나타나는 시신들의 사건을 수사하게 된다.
질리언 앤더슨
데이비드 듀코브니
미치 필레기
로버트 패트릭
안나베스 기쉬
제임스 픽켄스 주니어
윌리엄 B. 데이비스
제리 하딘
스티븐 윌리암스
니콜라스 레아
존 네빌
