Pilote de la série. Lorsqu'une des subordonnées disparaît au cours d'une mission secrète pour Starfleet, le capitaine Pike doit sortir de la retraite qu'il s'était imposée. Il doit s'efforcer de sauver sa Numéro un tout en apprenant à gérer les visions de son propre avenir qui lui ont été données.

Lors d'une mission d'enquête, l'U.S.S. Enterprise découvre qu'une comète va frapper une planète habitée. Ils essaient de rediriger la comète, mais ils découvrent qu'une ancienne relique extraterrestre enterrée sur la surface glacée de la comète les arrête. Alors que l'équipe tente de percer les secrets de la relique, Pike et Numéro Un traitent avec un groupe de fanatiques qui veulent empêcher l'U.S.S. Enterprise d'intervenir.

L'U.S.S. Enterprise est confronté une contagion qui ravage le vaisseau. Un par un, tout l'équipage est frappé d'incapacité, à l'exception de Numéro un, Una Chin-Riley, qui doit maintenant affronter un secret qu'elle cache alors qu'elle s'empresse de trouver un remède.

Lors d'une mission de ravitaillement de routine, l'U.S.S. Enterprise est attaquée par une force malveillante inconnue. Pike apporte tout son cœur et son expérience pour faire face à la crise, mais l'officier de sécurité l'avertit que l'ennemi ne peut pas être traité par les moyens conventionnels de Starfleet.

C'est une comédie de mœurs lorsque Spock a une visite personnelle au milieu de négociations cruciales entre lui, le Capitaine Pike et une espèce extraterrestre inhabituelle.

Une menace plane sur une planète idyllique et le capitaine Pike est réuni avec son amour perdu. Pour la protéger, elle et un enfant scientifique sacré d'un complot, Pike offre son aide et est obligé de faire face à aux sentiments enfouis dans son passé.