Après le meurtre de sa sœur, Bryan Mills, animé par la vengeance, se lance dans une dangereuse mission contre Carlos Mejia, parrain d’un cartel de drogue. Un groupe d’agents de la CIA, dirigé par Christina Hart, utilise Bryan comme appât pour capturer Mejia, et finit par recruter Bryan au sein de l’équipe.

Bryan obtient sa première chance sur le terrain, mais la mission tourne mal, entraînant une mort tragique. L'équipe découvre un détournement de fonds destinés à des refugiés, opéré par un groupe de fonctionnaires gouvernementaux. Lors de l'enquête, Christina se retrouve face à un ancien amour. Pendant ce temps, Asha se présente par surprise à la porte de Bryan.

Bryan et l'équipe sont à la recherche d’Amir Zahad suspecté d’être un terroriste et qui a été enlevé. L’enquête leur fait découvrir un plus gros complot au sein du gouvernement. Christina apprend des nouvelles troublantes et se tourne alors vers Harry pour avoir un peu de soutien. Asha fait part à Bryan de son inquiétude quant à son obsession envers Mejia.

L'insistance de Riley, pour faire la lumière sur une affaire de drogue mortelle donnée aux vétérans de guerre, a pour conséquence l'enlèvement d’une enfant. Bryan désobéit aux ordres afin de la retrouver et la sauver. Alors qu’Asha est sous le choc suite au cambriolage de son domicile, elle trouve du réconfort auprès de sa nouvelle voisine , Elena.

Christina ordonne la récupération de documents sensibles, pouvant déclencher un désastre économique et politique. Mais la mission d’infiltrer une banque à Zurich tourne mal. L’équipe doit alors tout mettre en œuvre pour fuir en toute sécurité. Pendant ce temps, la confiance d'Asha envers Elena se révèle préjudiciable mettant Bryan en danger.

L’équipe est chargée de faciliter l’extraction d’un agent russe, mais sa petite amie est enceinte, ce qui contrecarre le plan d’action de l’équipe. Pendant ce temps, Christina essaie de prouver qu’un indic se trouve au sein de la CIA. John tente quant à lui de résoudre les problèmes entre son frère et un gang local.