Le détective Steve McGarrett se rend à Oahu pour enquêter sur l'assassinat de son père. Une fois sur place, le gouverneur Jameson le persuade de rester et de former une unité spéciale de police, 5-O, pour combattre le crime à Hawaii. Il fait équipe avec le détective Danny Williams, venu du continent, ainsi que, Kono et Chin Ho, deux policiers natifs de l'île.

Un expert en cyber-terrorisme est kidnappé en pleine rue par un gang. L'homme vient de mettre au point une clé permettant de craquer les réseaux informatiques protégés. Steve, Danny, Chin et Kono sont chargés de le retrouver avant que la sécurité nationale ne soit gravement menacée.

Les Samoan et les Triades se livrent une guerre des gangs qui finit par éclater au grand jour lors d'un match de football américain à Honolulu. L'équipe de Steve travaille sous couverture pour infiltrer les deux gangs et éviter l'escalade.

Steven et Dano recherchent un dangereux évadé de prison et tentent d'éclaircir les raisons floues de son évasion. Mary, la soeur de Steven, est venue à Hawaii rendre visite à son frère qu'elle n'a pas vu depuis longtemps.

L'une des filles de l'ambassadeur américain des Philippines est retrouvée morte à Hawaii tandis que la seconde a disparu. Le gouverneur Jameson, proche de la famille, charge McGarrett et son équipe de l'affaire.

Le président du prestigieux championnat de surf de la côte nord d'Hawaii est assassiné le jour de l'inauguration de l'événement. Steven, Dano et Chin enquêtent sur le territoire des chasseurs ancestraux, d'où venait le coup de feu. De son côté, Kono, principale témoin du meurtre et proche du défunt, reprend contact avec un vieil ami pour mener l'enquête.