L’inspecteur Jake Peralta (Andy Samberg) est un inspecteur de police talentueux et relax. Ses collègues éclectiques du 99e commissariat de Brooklyn et lui ont pris l’habitude d’avoir des commissaires complaisants. Mais leur nouveau capitaine, Ray Holt (Andre Braugher), est plutôt du genre crispé.Quand il prend les choses en main, il est déterminé à ce que ce groupe de policiers dysfonctionnel devienne le meilleur commissariat de Brooklyn.

Quand Jake (Andy Samberg) est en retard pour l’appel, le capitaine Ray Holt (Andre Braugher) l’affecte à une affaire de graffiti qu’il interprète étant indigne de lui. Mais quand le coupable s’avère être le fils du sous-commissaire, l’affaire devient un problème épineux. Pendant ce temps, l’amie voyante (Chelsea Peretti) de Gina se rend au commissariat et réussit à pénétrer le mental de Charles (Joe Lo Truglio).

Jake se retrouve face à un tas de dossiers non élucidés ; les autres inspecteurs ne veulent pas que sa série d'échecs déteigne sur eux. Pendant ce temps, Holt demande à Amy de s'occuper du Programme de jeunes policiers, qui vise les jeunes à risque, et fait appel à Rosa et Gina. Boyle aide le sergent Jeffords à travailler sur un dossier qu'il n'arrive pas à boucler.

Au grand agacement de l'équipe, Jake fait la cour à une séduisante médecin légiste, le Dr Rossi (Mary Elizabeth Ellis), sur la scène d'un crime, ralentissant ce faisant le rapport de l'autopsie. Quand le Dr Rossi s'avère lui donner du fil à retordre, il se ravise. Pendant ce temps, l'enquête sur un voleur de sacs à main d'Amy est ralentie quand l'artiste médico-légal se retrouve en arrêt maladie, ce qui va lui permettre de découvrir les talents cachés du sergent Jeffords...

Un inspecteur (Dean Winters) du département des crimes graves reprend l'enquête de meurtre que Jake était sur le point de résoudre et lui vole la vedette. Autour de quelques verres, Jake fait appel à l'aide du commissariat pour se venger et retrouver l'arme du meurtre avant le « Vautour ». De l'autre côté de la ville, le capitaine Holt et Gina aide Terry à récupérer son permis de port d'arme.

C'est la nuit d’Halloween, une période tumultueuse de l'année pour tous les commissariats de police. Amy déteste cette fête et n'est pas ravie de devoir enfiler un déguisement pour une mission d'infiltration dans le quartier avec Charles. Au commissariat, Jake parie au capitaine Holt qu'il réussira à voler sa médaille avant minuit, l'obligeant aussi à revêtir plusieurs déguisements.