24世紀の末。宇宙艦隊を14年前に引退したジャン＝リュック·ピカード（パトリック·スチュワート）はワイン農園シャトー·ピカードで静かな生活を送っていた。そこへ謎の若い女性（イサ·ブリオネス）が現れて助けを求める。ピカードの過去に関係があるらしい。

ピカードはダージの謎について調査を始める。彼女の存在が惑星連邦に持つ意味とは？ 宇宙艦隊の支持を得られないピカードはやむをえず、アグネス・ジュラティ博士（アリソン・ピル）や疎遠となったかつての同僚ラフィ（ミシェル・ハード）に協力を求める。一方、姿を見せない敵もまた、ダージの真相を探るピカードがたどり着く先に関心があるのだ。

ソージは自分の正体にまったく気づかないまま研究を続けて、ボーグ・キューブ再生プロジェクトの最高責任者に注目される。ピカードはラフィと過去を語り合うが、ラフィは協力を渋る。あくまでブルース・マドックスを探し求めるピカードは他にも協力者を求める。その１人はパイロットで元宇宙艦隊士官のリオス（サンティアゴ・カブレラ）だ。

フリークラウドをめざす一行は、ピカードの命令で惑星ヴァシュティに寄り道する。14年前にピカードとラフィがロミュラン人の難民を移住させた場所だ。ヴァシュティに降り立ったピカードは、移住中に親しくなったロミュラン人の若者エルノア（エヴァン・エヴァゴラ）と再会する。一方、ナレクはソージについて学ぼうと試み続けるが、ナリッサは進展がないと焦燥感を募らせる。

シレーナ号はブルース・マドックスを捜してフリークラウドへ。予断を許さない探検の始まりだ。マドックスは窮地に陥っているが、ある人物が援助を申し出る。

ピカードたちはソージを捜して、ロミュラン領にあるボーグ・キューブへ。ピカードには忘れられない思い出がよみがえる。一方、ナレクはついにソージから安全に情報を引き出す方法を見つける。