Inspirée de l'histoire vraie d'un homme qui a dirigé le plus vieil hôpital public des Etat-Unis, cette série médicale poignante nous emmène aux côtés du Docteur Max Goodwin (Ryan Eggold) aussi charmant que brillant, alors qu'il révolutionne un système qui est en panne afin de soigner au mieux les patients les plus démunis. Figure très inspirante pour tous ceux qui l'entourent, le Docteur Goodwin ne baisse les bras devant aucun obstacle et apporte un souffle nouveau à un hôpital qui manque de personnel, d'argent et de considération alors que c'est le seul établissement au monde capable d'accueillir aussi bien des patients atteints par le virus Ebola que des prisonniers de Rykers Island, ou bien encore le Président des Etats-Unis.

Max (Ryan Eggold) se confronte à son diagnostic tandis que le Dr Sharpe (Freema Agyeman) l'encourage à établir un plan d'attaque. Pendant ce temps, le Dr Bloom (Janet Montgomery) encourage Reynolds (Jocko Sims) à prendre un risque. Le Dr Kapoor (Anupam Kher) et Iggy (Tyler Labine), quant à eux, unissent leurs efforts pour soigner un enfant.

Reynolds (Jocko Sims) commence à monter son équipe de cardiologues, tandis que Sharpe (Freema Agyeman) est confrontée au scepticisme de certains patients à son égard. Pendant ce temps-là, Max (Ryan Eggold), qui refuse toujours de faire face à sa maladie, aide Bloom (Janet Montgomery) à trouver une solution pour une femme enceinte, détenue à la prison de Rikers Island.

Lorsque Max propose d'accueillir à New Amsterdam les patients d'un hôpital voisin en sous-effectif, le chaos s'installe rapidement.

Un journaliste suit Max (Ryan Eggold) toute la journée à New Amsterdam en vue d'un article sur l'hôpital. Bloom (Janet Montgomery) et Reynolds (Jocko Sims) se brouillent suite à une décision de Bloom allant à l'encontre du protocole. Kapoor (Anupam Kher) de son côté, doit soudainement affronter son passé.

Le gala caritatif annuel de l'hôpital approche et Max (Ryan Eggold) est sous pression. La présence de membres de la famille de certains médecins à cet événement exa-erbe les émotions. Iggy (Tyler Labine) cherche le moyen d'annoncer une nouvelle délicate à sa fille tandis que Bloom (Janet Montgomery) et Reynolds (Jocko Sims) continuent d'affronter les conséquences de leur dispute. Pendant ce temps, Kapoor (Anupam Kher) et le Dr Sharpe (Freema Agyeman) coopèrent pour découvrir la pathologie d'un homme et de son fils.